Unter Aufsicht des Apothekers geben Pharmazeutisch-technische Assistenten verschreibungspflichtige Arzneimittel entsprechend Rezept an Kunden ab, verkaufen rezeptfreie Medikamente, homöopathische Arzneimittel und andere apothekenübliche Waren. Dabei beraten sie die Kunden auch, erklären z.B., wie ein Produkt anzuwenden ist oder weisen auf Einnahmebesonderheiten hin. Zudem erledigen sie kaufmännisch-verwaltende Tätigkeiten, überwachen im Apotheken-Lager etwa den Warenbestand und organisieren die Bestellungen. Sie führen die gesetzlich vorgeschriebenen Stichproben sowie Lagerkontrollen durch und registrieren die Ausgabe und den Bestand von Giften und Betäubungsmitteln. Im Apotheken-Labor stellen sie unter Aufsicht Arzneimittel her, z.B. Salben oder Lösungen. Dabei kontrollieren sie nach den Vorgaben im Arzneibuch die einzusetzenden Grundsubstanzen und dosieren diese exakt. Darüber hinaus führen sie einfache chemische und physikalische Arzneimittelanalysen durch oder messen z.B. Cholesterin-, Harn- oder Blutwerte von Kunden. Für spezielle Beratungsaktionen, z.B. zum Thema Allergien, stellen sie Informationen zusammen und wirken bei Aktionen und Veranstaltungen mit. Insbesondere, wenn Pharmazeutisch-technische Assistenten in pharmazeutischen Forschungslabors arbeiten, können sie auch an der Entwicklung und Synthese neuer Wirkstoffe beteiligt sein. In der Pharmaindustrie arbeiten sie im Herstellungsprozess von Pharma- und Kosmetikprodukten mit.